根据刑事诉讼法第二百五十六条规定，当事人、辩护人、代理人对经侦察阅卷、侦查或审查的数量证据有异议的，可以在审查阶段或者审判阶段向人民法院提出重新鉴定的申请。而刑事诉讼法第二百五十七条规定，刑事诉讼法第二百五十六条规定的情形之外，对证据有疑问的，可以在判决发生法律效力后十五日内，向法院提出重新鉴定的申请。
进行重新鉴定的程序主要分为两阶段：审查阶段和审判阶段。在审查阶段，当事人需要向人民法院提出重新鉴定的申请，并说明理由。法院会根据当事人提出的申请进行审查，决定是否需要进行重新鉴定。如果法院认为有必要，则会指定专门的鉴定机构进行重新鉴定。
在审判阶段，如果当事人对证据有疑问，可以在判决发生法律效力后十五日内提出重新鉴定的申请。法院会在收到申请后进行审查，如果认为有必要，会指定专门的鉴定机构进行重新鉴定。需要注意的是，在审判阶段提出重新鉴定申请的时间是有限制的，超过规定的时间限制，法院将不予受理。
重新鉴定的目的在于确定证据的真实性和可靠性，保障当事人的合法权益。重新鉴定的申请必须合法合理，并且要求提供充分的理由和证据。法院在审查重新鉴定申请时，将根据具体情况进行综合考虑，并依据刑事诉讼法的相关规定进行处理。
刑事诉讼法对重新鉴定的规定明确详细，当事人在申请重新鉴定时需遵循规定的流程和事项，确保申请的合法性和时效性。重新鉴定程序的实施有助于维护司法公正，保障当事人的合法权益。